由于清洁生产属于循环经济的一个子系统，后者通过并实施后，将会和前者产生一些矛盾，有人认为应废除前一个法律（但目前没有）。例如，前者规定，经济贸易行政主管部门负责组织、协调全国的清洁生产促进工作。后者规定，发改部门负责组织、协调全国的循环经济工作。而2003年机构改革后，国家经贸委已经撤销，地方各级政府部门却没有撤销该部门。这就产生了发改委和地方经贸委的管理真空问题。

循环经济体系是以产品清洁生产、资源循环利用和废物回收为特征的生态经济体系。由于它将对环境的破坏降到程度，并且限度地利用资源，因而大大降低了经济发展的社会成本，有利于经济的可持续发展。对于我国而言，大力发展循环经济，是走新型工业化道路的题中应有之义。各级政府作为建立循环经济社会机制的主体，应抓紧制定相关的法规政策，逐步建立健全适应循环经济发展要求的管理体制和机制